در این مدت، چندین مرتبه به جبهه عزیمت کرد و وقتی از جبهه باز میگشت به خانواده شهدا و رزمندگان سرکشی میکرد. آخرین مسوولیت شغلی وی خبرنگاری برای روزنامه جمهوری اسلامی در بم بود. او در عملیات کربلای5 حضور فعال داشت و فرمانده دسته بود و در همین عملیات به آرزوی دیرینه خود رسید و شهید شد.
در وصیت نامه شهید مرتضی چمن آمده است؛ پروردگارا تو را سپاسگزارم که توفیقی نصیبم کردی که در خدمت سربازان امام زمان(عج) و خونخواهان امام حسین(ع) و شهدای کربلا و شهدای جمهوری اسلامی باشم. پروردگارا در این راه مقدس که دفاع از دین مقدس اسلام و جمهوری اسلامی است مرا ثابت قدم بدار تا در نبرد با دشمنان دینت آنگونه که تو راضی باشی انجام وظیفه کنم. خداوندا، کریما، رحیما، اگر مصلحت میدانی، ظهور حضرت مهدی عجلالله تعالی فرجه الشریف را نزدیکتر بگردان. از معلمین محترم تقاضا دارم که با تربیت صحیح دانشآموزان، جایی برای فعالیت منافقین و کفار در مدارس و دانشگاه ها نگذارند و انجمن های اسلامی را تقویت کنند. مادرجان! اگر از خبر شهادت من باخبر شدید، به یاد زینت(س) خواهر بزرگوار امام حسین(ع) باشید و برای مظلومیت آن بزرگوار گریه کنید. میدانم که حق داری گریه کنی اما برای علی اکبر(ع) امام حسین و هفتاد و دو تن از شهدای کربلا گریه کن.